Screening, biochemical characterization and antibiotics resistance/susceptibility of bacteria isolated from native soil and water samples / Triagem, caracterização bioquímica e resistência/suscetibilidade a antibióticos de bactérias isoladas de amostras nativas de solo e água

The present study was conducted to isolate and characterize bacteria from water and soil sample taken from the Lahore Canal at different sites i.e. Mall Road, Mohlanwal and Khera site. Isolated bacterial strains were identified on the basis of morphological and biochemical tests. Identification was confirmed by culturing bacteria on selective media. Antibiotic resistance test was also performed to observe the resistance of bacteria against different antibiotics. Blood agar test was performed for identification of different pathogenic bacteria. The result revealed that water and soil samples of Lahore Canal Lahore from different sites were contaminated with Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. and Staphylococcus spp. Due to presence of these pathogens, this water is not suitable for any domestic and irrigation use. Study also revealed that water of the Lahore Canal is harmful for human health as it is contaminated with bacteria that can cause severe disease e.g., Escherichia coli can cause gastroenteritis, Bacillus spp. can cause nausea and vomiting, Enterococcus may infect urinary tract, Salmonella sp. is responsible for Bacteremia, Staphylococcus spp. can cause mild fever and Vibrio sp. can be the reason of cholera. Thus it is rendered unfit for any kind of human use even other than drinking like swimming, bathing, washing etc., until and unless some remedial measures are employed to eradicate pathogenic microorganisms by WASA and LWMS according to standards of WHO. Similarly, it is quite harmful, when and where ever it is used for irrigation without proper treatment.

O presente estudo foi realizado para isolar e caracterizar bactérias de amostras de água e solo retiradas do Canal Lahore, em Lahore, em diferentes locais, ou seja, Mall Road, Mohlanwal e Khera. As cepas bacterianas isoladas foram identificadas com base em testes morfológicos e bioquímicos. A identificação foi confirmada por cultura de bactérias em testes de meios seletivos. O teste de resistência aos antibióticos também foi realizado para observar a resistência das bactérias a diferentes antibióticos. Foi realizado o teste de ágar sangue para identificar diferentes bactérias patogênicas. O resultado revelou que amostras de água e solo do Canal Lahore, Lahore, de diferentes localidades estavam contaminadas com Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. e Staphylococcus spp. Por causa da presença desses patógenos, essa água não é adequada para qualquer uso doméstico e de irrigação. O estudo revelou que a água do Canal Lahore é prejudicial à saúde humana, pois está contaminada com bactérias que podem causar doenças graves, por exemplo: Escherichia coli pode ocasionar gastroenterite; Bacillus spp. pode causar náuseas e vômitos; Enterococcus sp. pode infectar o trato urinário; Salmonella sp. é responsável pela bacteremia; Staphylococcus spp. pode causar febre leve; e Vibrio sp. pode ser a razão da cólera. Assim, torna-se imprópria para uso humano, como natação, banho, lavagem etc., até que algumas medidas corretivas sejam empregadas para erradicar microrganismos patogênicos por WASA e LWMS de acordo com os padrões da OMS. Da mesma forma, é bastante prejudicial, quando usada para irrigação sem tratamento adequado.

Resistencia bacteriana a antibióticos en ambientes acuáticos: origen e implicaciones para la salud pública

El alarmante incremento de la resistencia bacteriana a los antibióticos a nivel global ha dilucidado otras fuentes diferentes al hospital y la comunidad, donde el agua ha cobrado gran importancia. El ambiente acuático constituye la fuente y el hábitat natural de un gran número de microorganismos, incluyendo bacterias resistentes a antibióticos; así mismo, se considera uno de los principales receptores de antimicrobianos, bacterias resistentes y genes de resistencia a antibióticos provenientes de las actividades humanas. La contaminación del agua con estos contaminantes emergentes tiene implicaciones serias para la salud humana, relacionadas con la diseminación de la resistencia bacteriana y la emergencia de nuevos mecanismos de resistencia. En esta revisión se brinda una descripción global del papel de los ambientes acuáticos en el problema de la resistencia bacteriana, las principales fuentes de contaminación, además del impacto para la salud pública. Ante este panorama, se establece la necesidad de abordar la problemática de la resistencia bacteriana desde la perspectiva de "una salud", donde a la vigilancia tradicional, enfocada a nivel humano y veterinario, se articule la vigilancia epidemiológica ambiental, principalmente basada en aguas residuales.

The alarming increase in bacterial resistance to antibiotics globally has diluted sources other than the hospital and community, where water has taken on great importance. The aquatic environment is the source and natural habitat of a large number of microorganisms, including antibiotic-resistant bacteria, as well as being considered one of the main receptors for antimicrobials, resistant bacteria and antibiotic resistance genes from human activities. Contamination of water with these emerging contaminants has serious implications for human health related to the spread of bacterial resistance and the emergence of new resistance mechanisms. This review provides a global description of the role of aquatic environments in the problem of bacterial resistance, the main sources of contamination, as well as the impact on Public Health. In this context, the need arises to address the problem of bacterial resistance from the perspective of "one health", where traditional surveillance, focused at the human and veterinary level, is articulated with environmental epidemiological surveillance, mainly in wastewater.

O incremento alarmante da resistência bacteriana aos antibióticos no nível global tem revelado outras fontes diferentes do hospital e da comunidade, em que a água tem ganho grande importância. O ambiente aquático constitui a fonte e o hábitat natural de um grande número de microrganismos, incluindo bactérias resistentes a antibióticos; é considerado, também, um dos principais receptores de antimicrobianos, bactérias resistentes e genes de resistência a antibióticos provindos das atividades humanas. A poluição da água com esses poluentes emergentes tem sérias implicações para a saúde humana, relacionadas com a disseminação da resistência bacteriana e a emergência de novos mecanismos de resistência. Nesta revisão oferece-se uma descrição global do papel dos ambientes aquáticos na situação problemática da resistência bacteriana, as principais fontes de poluição, além do impacto para a saúde pública. Diante desse panorama, determina-se a necessidade de abordar a problemática da resistência bacteriana desde a perspectiva de "uma saúde" em que a vigilância tradicional, focada nos níveis humano e veterinário, esteja articulada com a vigilância epidemiológica ambiental, principalmente baseada em águas residuais.

Lineamientos técnicos para el manejo hospitalario de meningitis bacteriana aguda causada por Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae tipo b y Streptococcus agalactiae / Technical guidelines for hospital management of acute bacterial meningitis caused by Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae type b and Streptococcus agalactiae

En este contexto la Oficina de Enfermedades Infecciosas del Ministerio de Salud, retoma el compromiso, considerando oportuno modificar lo dispuesto en los "Lineamientos técnicos sobre el manejo de pacientes con enfermedad meningocócica" elaborados en el año 2018, ampliando su ámbito hacia los 4 grupos de bacterias mencionadas, siendo esta una herramienta de apoyo clínico que permita al personal de salud encargado de la atención de estos pacientes, establecer medidas efectivas de manejo, control y prevención a nivel hospitalario, los cuales se vinculan al cumplimiento del pilar 2 y complementa las acciones de los pilares 1, 3, 4 y 5 como parte de la estrategia nacional integral dentro del contexto de la hoja de ruta global "Derrotando a la meningitis al 2030"

In this context, the Office of Infectious Diseases of the Ministry of Health takes up the commitment, considering appropriate to modify the provisions of the "Technical guidelines on the management of patients with meningococcal disease" elaborated in 2018, extending its scope to the 4 groups of bacteria mentioned, this being a clinical support tool that allows health personnel in charge of the care of these patients to establish effective management, control and prevention measures at hospital level, which are linked to pillar 2 compliance and complements pillar 1, pillar 3, pillar 4 and pillar 5 actions as part of the comprehensive national strategy within the context of the global roadmap "Defeating meningitis by 2030"

Biological control of foodborne pathogens by lacticacid bacteria: A focus on juice processing industries

Abstract The use of lactic acid bacteria (LAB) in foods as biocontrol agents against foodborne pathogens has become increasingly known. Under the premise that controlling the adhesion of microorganisms to food contact surfaces is an essential step for meeting the goals of food processing, the aim of this work was to investigate the inhibitory and anti-biofilm effectiveness of Lactobacillus rhamnosus GG (ATCC 53103) and Lactobacillus casei (ATCC 393) against Escherichia coli O157:H7, Salmonella enterica and Listeria monocytogenes. Lactobacillus strains (108UFCCFU/ml) and pathogens (104UFCCFU/ml) were evaluated to monitor LAB anti-adhesive and antibiofilm effect, in two main scenarios: (i) co-adhesion and (ii) pathogen incorporation to stainless steel surfaces with a protective biofilm of Lactobacillus cells. In (i) the predominant effect was observed in L. rhamnosus against S. enterica and L. monocytogenes, whereas in (ii) both LAB significantly reduced the number of pathogenic adherent cells. The effect of pre-established LAB biofilms was more successful in displacing the three pathogens than when they were evaluated under co-adhesion. These findings show that both LAB can be considered good candidates to prevent or inhibit the adhesion and colonization of L. monocytogenes, S. enterica and E. coli O157:H7 on surfaces and conditions of relevance for juice processing industries, offering alternatives for improving the safety and quality of fruit-based products.

Resumen Existe un creciente interés en el uso de bacterias ácido lácticas (BAL) como agentes de biocontrol frente a patógenos de transmisión alimentaria. Bajo la premisa de que el control de la adhesión de microorganismos a superficies de contacto con alimentos es el paso esencial para evitar su contaminación, el objetivo de este trabajo fue investigar la efectividad inhibitoria y antibiofilm de Lactobacillus rhamnosus GG (ATCC 53103) y Lactobacillus casei (ATCC 393) frente a Escherichia coli O157:H7, Salmonella enterica y Listeria monocytogenes. A fin de cumplir con el objetivo propuesto, las cepas de Lactobacillus (108UFCUFC/ml) y los patógenos (104UFCUFC/ml) se ensayaron en 2 escenarios: (1) coadhesión, y (2) incorporación de los patógenos a las superficies de acero inoxidable con un biofilm preformado de Lactobacillus. En (1), el efecto predominante se observó con L. rhamnosus frente a S. enterica y L. monocytogenes, mientras que en (2), ambas BAL redujeron significativamente el número de células patógenas adheridas. En función de estos resultados, concluimos que el efecto de un biofilm preformado de ambas BAL fue más exitoso en el desplazamiento de los 3 patógenos que en coadhesión. Ambas BAL pueden considerarse buenas candidatas para mitigar la adhesión y colonización de L. monocytogenes, S. enterica y E. coli O157:H7 en superficies en condiciones de relevancia para la industria procesadora de jugos, y, de esta manera, ofrecer alternativas para mejorar la seguridad y calidad de los alimentos a base de frutas.

Silage quality and bacterial diversity of silages inoculated with Listeria monocytogenes and Lacticaseibacillus paracasei_6714

Introduction: King grass (Cenchrus purpureus (Schumach.) Morrone, syn. Pennisetum purpuphoides) and pineapple peel (Ananas comosus) silages are food alternatives for livestock in conditions of feed shortage. Objective: To describe the dynamics of the microbiota present in king grass and pineapple silage during the fermentation process using next generation sequencing (NGS) and to evaluate the protective effect of Lacticaseibacillus paracasei_6714 as a silage inoculum against Listeria monocytogenes. Methods: We used an unrestricted randomized design to characterize the microbiota present in silages made from king grass harvested 70 days after regrowth and pineapple peel. We inoculated mixtures of grass and peel with L. paracasei_6714 or L. monocytogenes, or both, with a non-inoculated treatment as control. The nutritional and fermentative profile was evaluated after 30 days. After 15 and 30 days of fermentation, we used 16S rRNA analysis to determine the dynamics and diversity of the microbiota in the inoculated and control silages. Result: Dry matter content and digestibility did not differ significantly; however, there were differences in crude protein, pH and organic acids. We obtained 4432 amplicon sequence variants of Proteobacteria, Firmicutes, Bacterioidetes, Actinobacteria, Verrucomicrobia, Planctomycetes and Patescibacteria. The relative abundance of each phylum varied depending on the material and fermentation period. Phylum similarity was over 70 % (but not greater than 50 % with Bray-Curtis at the species level). Conclusion: These bacterial communities seem to have an important role during silage fermentation. Proper management of silage processing can reduce or eliminate pathogenic bacteria.

Introducción: Los ensilajes del pasto king grass (Cenchrus purpureus (Schumach.) Morrone, syn. Pennisetum purpuphoides) y cáscaras de piña (Ananas comosus) son alternativas de alimento para ganado en condiciones de escasez alimentaria. Objetivo: Describir las dinámicas de la microbiota presente en los ensilajes de king grass y piña durante el proceso de fermentación usando secuenciación de próxima generación (NGS) y evaluar el efecto de protección de Lacticaseibacillus paracasei_6714 como inoculante de ensilaje ante Listeria monocytogenes. Métodos: Usamos un diseño aleatorio no restringido para caracterizar la microbiota presente en ensilajes de king Grass cosechados 70 días después de rebrote y de cáscaras de piña. Inoculamos mezclas de pasto y cáscara con L. paracasei_6714 o L. monocytogenes, o ambos, con un tratamiento control sin inocular. El perfil nutricional y de fermentación fue evaluado luego de 30 días. Después de 15 y 30 días de fermentación, usamos un análisis de para determinar la dinámicas y diversidad de la microbiota en los ensilajes inoculados y control. Resultados: Los contenidos de materia seca y digestibilidad, no difirieron significativamente; sin embargo, hubo diferencias en proteína cruda, pH y ácidos orgánicos. Obtuvimos 4 432 secuencias variantes de amplicon de Proteobacteria, Firmicutes, Bacterioidetes, Actinobacteria, Verrucomicrobia, Planctomycetes y de Patescibacteria. La abundancia relativa de cada filo vario dependiendo del material y periodo de fermentación. Similitudes de filo fueron mayores al 70 % (pero no mayor que 50 % con Bray-Curtis a nivel de especie). Conclusión: Estas comunidades bacterianas parecen cumplir un papel importante durante la fermentación del ensilaje. Un manejo apropiado del proceso de ensilaje puede reducir o eliminar baterías patogénicas.

Calidad microbiológica de embutidos crudos: estudio del caso en Latinoamérica / Microbiology of raw sausages: a case of study in Latin America

Introducción. Los embutidos crudos se componen de carne fragmentada y otros ingredientes no cárnicos (sal, especias, fosfatos, nitritos) pero cuya formulación varía según el país; son productos altamente perecederos y podrían representar un riesgo para el consumidor. Objetivo. Los embutidos frescos son de alto consumo en varios países de Latinoamérica, por ello, el objetivo de esta revisión bibliográfica es compilar la información disponible sobre la calidad microbiológica de este tipo de productos en la región. Materiales y métodos. Se realizó una búsqueda de literatura (desde el 2006 a la fecha) en las principales bases de datos. Resultados. Se determinó que la calidad microbiológica de los embutidos crudos latinoamericanos no es adecuada según la reglamentación. Las bacterias más estudiadas son los microorganismos totales aerobios mesófilos (MTAM), y las bacterias ácido-lácticas (BAL); estos dos grupos son los referentes para determinar la vida útil. Los patógenos más analizados son Salmonella spp. y Listeria monocytogenes y llama la atención que Staphyloccoccus aureus no se utiliza como indicador de malas prácticas de higiene o de inocuidad. Conclusiones. En general se confirma que los embutidos frescos podrían ser un riesgo para la salud pública ya que presentan recuentos microbiológicos altos, en ocasiones no regulados. Algunos agentes antimicrobianos como los compuestos etanólicos de propóleos (EEP), compuestos fenólicos y bacteriófagos han sido estudiados. Sin embargo, no está claro si a nivel artesanal este tipo de ingredientes son utilizados del todo. Finalmente, destaca la necesidad de armonizar las metodologías de estudio y la normativa vigente en los distintos países(AU)

Introduction. Raw sausages are products composed of comminuted meat and other non- meat ingredients (salt, spices, phosphates, nitrites) but the formulation varies in each country. Given this nature, raw sausages are highly perishable and may represent an important risk for consumers. Aim. As raw sausages are highly consumed in many Latin-American countries, the objective of this literature review was to compile the available information about studies of the microbial quality of these products in the region. Materials and methods. For that purpose, a literature search was performed on main data bases to compile studies from 2006 to nowadays. Results. In general, it was found that microbiological quality of Latin-American raw sausages is not adequate according to current regulation. Total aerobic mesophilic microorganisms (TAMM) and Lactic Acid Bacteria (LAB) were the most studied indicators; these two groups are the main reference to establish shelf life. Salmonella spp. and Listeria monocytogenes were the most studied pathogens, and it is noticeable that Staphyloccoccus aureus is not used as an indicator for safety or manipulation. Conclusions. It is perceived that raw sausages in the region could represent a public health risk as they frequently present high microbiological counts, not regulated in many cases. For conservation, antimicrobial agents as propolic ethanoplic extracts (PEE), phenolyc compounds, and bacteriophages have been studied. However, it is not clear if these ingredients are used at the artisanal level, even though it can be assumed that they are not given the high microbial numbers that are reported. Finally, it stands out the need of harmonization of methodologies and current regulation in the countries(AU)

Evaluación de la formación de biopelículas en aislamientos bacterianos y fúngicos por el método semicuantitativo de microtitulación con cristal violeta y el cualitativo de agar con rojo Congo / Assessment of biofilms formation of bacterial and fungal isolates using qualitative Congo red agar and semiquantitative crystal violet microtiter methods

Introducción. El 65 % de las infecciones humanas son producidas por bacterias o levaduras, cuya capacidad de formar biopelículas las hace más resistentes a los antimicrobianos y antifúngicos. Objetivo. Determinar la capacidad de formación de biopelículas en aislamientos bacterianos y fúngicos por medio de los métodos cuantitativo de microtitulación con cristal violeta y cualitativo de cultivo en agar con rojo Congo. Materiales y métodos. Con el método cuantitativo, se utilizaron los medios de cultivo infusión cerebro-corazón, tripticasa de soya y Müeller-Hinton para aislamientos bacterianos; para levaduras, se usaron caldo infusión cerebro-corazón y Sabouraud dextrosa. Para el método cualitativo de cultivo en agar, se utilizaron los mismos medios de cultivo más una solución con 3 % de rojo Congo y 10 % de dextrosa. Cómo método de referencia, se utilizó la propuesta de Stepanovic et al. Resultados. Se evaluaron 103 aislamientos bacterianos y 108 de levaduras. No es recomendable sustituir el caldo infusión cerebro-corazón por los caldos tripticasa de soya y Müeller-Hinton en el método cuantitativo, para evaluar la formación de biopelículas en los aislamientos bacterianos. El medio Sabouraud dextrosa, en caldo y agar, puede sustituir al de infusión de cerebro-corazón para evaluar la formación de biopelículas en levaduras, tanto por el método cuantitativo como por el cualitativo. Conclusión. El estudio de las biopelículas en el laboratorio de microbiología, a partir del método cualitativo de cultivo en agar con rojo Congo, es un procedimiento sencillo, rápido y de bajo costo, que proporciona información útil para el diagnóstico y la terapéutica de infecciones persistentes causadas por bacterias y levaduras.

Introduction. Sixty-five percent of human infections are caused by bacteria or yeasts able to form biofilms. This feature makes them more resistant to antimicrobials and antifungals. Objective. To determine biofilm formation capacity of bacterial and fungal isolates by quantitative crystal violet microtiter and qualitative Congo red agar methods. Materials and methods. Brain-heart infusion, trypticase soy broth and Müeller-Hinton culture media were used in bacterial isolates for the quantitative method; brain-heart infusion broth and Sabouraud dextrose were used for yeasts. The same culture media plus 3% Congo red and 10% dextrose were used to apply the qualitative method in agar. The proposal by Stepanovic, et al. was used as a reference method. Results. We evaluated 103 bacterial isolates and 108 yeasts isolates. We did not recommend substitute brain-heart infusion broth for trypticase soy and Müeller-Hinton broths for biofilm formation assessment in bacterial isolates using the quantitative method. Sabouraud dextrose medium, both broth and agar, can replace brain-heart infusion to assess biofilm formation in yeasts, quantitatively and qualitatively. Conclusion. The study of biofilms in the microbiology laboratory, using Congo red agar qualitative method, is a simple, fast, and inexpensive procedure that provides precise information for the diagnosis and treatment of persistent infections caused by bacteria and yeasts.

Prevalencia de bacterias multidrogoresistentes en un hospital público ubicado en la sierra del Perú

Introducción. La resistencia antibiótica es una de las mayores amenazas para la salud global. Una de las estrategias para su control, es la vigilancia microbiológica. Objetivo. Describir la variación de la prevalencia de cepas multidrogoresistentes (MDR) de las bacterias más frecuentemente aisladas en muestras clínicas de pacientes atendidos en un hospital de tercer nivel de una ciudad de altura en el Perú, y determinar los factores asociados a su aislamiento. Además, evaluar la prevalencia de otros fenotipos de resistencia. Métodos. Se realizó un estudio observacional transversal a partir de una cohorte histórica de aislamientos entre los años 2012 y 2019. Resultados. La prevalencia general de cepas MDR fue 74,1%, observándose una tendencia a la disminución de la prevalencia anual de cepas de MDR en cinco de las nueve bacterias analizadas. Los factores asociados a cepas MDR se correspondían con los descritos previamente: sexo masculino, edad mayor a 75 años y hospitalización en servicios de cuidados intensivos. Además, se observó un incremento en la prevalencia de otros fenotipos de resistencia. Conclusión. Se encontró una alta prevalencia de cepas MDR en todas las bacterias evaluadas, asociadas a factores previamente descritos.

Introduction. Antibiotic resistance is one of the greatest threats to global health. One of the strategies for its control is microbiological surveillance. Objective. To describe the variation of the prevalence of multidrug resistant strains (MDR) of the most frequently isolated bacteria in clinical samples of patients treated at a tertiary care hospital in a high-altitude city in Perú and the factors associated with its isolation. Also, to assess the prevalence of other resistance phenotypes. Results. The general prevalence of MDR strains was 74,1%, observing a downward trend in the annual prevalence of MDR strains in five of the nine bacteria included. The factors associated with MDR strains corresponded to those previously described: male sex, age over 75 years, and hospitalization in intensive care services. In addition, an increase in the annual prevalence of other resistance mechanisms was evidenced. Conclusions. A high prevalence of MDR strains was found in all the bacteria evaluated, associated with previously described factors.

Frecuencia de Bacilos Gram Negativos en la cavidad bucal de estudiantes de una Universidad de Asunción

Introducción: La cavidad bucal hospeda una gran cantidad de microorganismos, como los bacilos Gram negativos, y entre ellas, bacterias de gran importancia médica debido a su capacidad de producir enfermedades graves para el ser humano, especialmente en pacientes inmunodeprimidos. El objetivo de este trabajo fue determinar la presencia de Bacilos Gram Negativos y sus patrones de resistencia a antibióticos, en una población estudiantil de la ciudad de Asunción, en los años 2019 y 2020. Materiales y métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo de corte transversal, donde se realizaron hisopados de la cavidad bucal a 35 alumnos de entre 18 a 24 años, de una universidad privada en la ciudad de Asunción. Se requirió consentimiento informado firmado por los participantes y fueron excluidos quienes tuvieron tratamientos antibióticos. Las muestras fueron obtenidas con un hisopo de algodón, posteriormente se colocaron en un medio de transporte para luego ser cultivadas en Agar MacConkey. El cultivo se realizó por 48 horas a 37° centígrados, luego se procedió a la identificación bacteriana. Por último, se realizó el antibiograma. Resultados: De los 35 alumnos se encontró una frecuencia de 48,57% de bacilos Gram negativos. Cepas de Klebsiella pneumoniae fueron las más frecuentes (35,29%). Se observó que las bacterias eran altamente resistentes a la Amoxicilina/Ácido Clavulánico. Conclusiones: La presencia de estos tipos de microorganismos puede ser peligrosa para la salud general de las personas, específicamente de los pacientes con algún tipo de inmunodepresión, debido a la gran la resistencia a antibióticos presentadas por algunas cepas.

Introduction: The oral cavity hosts a large number of microorganisms, such as Gram negative bacilli, and among them, bacteria of great medical importance due to their capacity to cause serious diseases for humans, especially in immunosuppressed patients. The objective of this work was to determine the presence of Gram Negative Bacilli and their patterns of resistance to antibiotics, in a student population of the city of Asunción, in the years 2019 and 2020. Materials and methods: An observational, descriptive cross-sectional study was carried out, where oral cavity swabs were made from 35 students between 18 and 24 years of age, from a private university in the city of Asunción. Informed consent signed by the participants was required and those who had antibiotic treatments were excluded. The samples were obtained with a cotton swab, later they were placed in a transport medium to later be cultured in MacConkey Agar. The culture was carried out for 48 hours at 37° Celsius, then the bacterial identification was carried out. Finally, the antibiogram was performed. Results: Of the 35 students, a frequency of 48,57% of Gram negative bacilli was found. Klebsiella pneumoniae strains were the most frequent (35.29%). The bacteria were found to be highly resistant to Amoxicillin/Clavulanic Acid. Conclusions: The presence of these types of microorganisms can be dangerous for the general health of people, specifically of patients with some type of immunosuppression, due to the great resistance to antibiotics presented by some strains.

Panorama da qualidade biológica da água destinada ao tratamento dialítico em pacientes sob cuidados críticos em Unidades de Terapia Intensiva / Overview of the biological quality of water intended for dialysis treatment in patients under critical care in Intensive Care Units

A incidência da lesão renal aguda caracteriza-se como evento frequente em pacientes críticos internados em Unidades de Terapia Intensiva e está associada ao aumento de mortalidade, causando grande impacto à Saúde Pública. As intercorrências clínicas são minimizadas com intervenções dialíticas, acarretando a exposição do paciente a volumes expressivos de água tratada durante a terapia renal em leito. As análises microbiológicas e de determinação de endotoxinas bacterianas em amostras de água tratada e em soluções de dialisato foram executadas em dois hospitais públicos do município de São Paulo, seguindo metodologias analíticas preconizadas em compêndios oficiais. A avaliação demonstrou que a porcentagem de resultados satisfatórios no período de 2010 a 2022 variou entre 35,2 a 100% e de 40 a 100% para as unidades hospitalares I e II para a água tratada, respectivamente; e, 100% para as soluções de dialisato para a unidade hospitalar I. A eficácia de ações delineadas pelas equipes técnicas das unidades hospitalares, na adequação da água destinada à terapia dialítica, aponta para a importância em estimular outras instituições hospitalares na padronização e implantação de melhoria contínua de seus sistemas de tratamento de água para uso em procedimento dialítico, prevenindo riscos adicionais aos pacientes expostos à terapia renal. (AU)

The incidence of acute kidney is high among critically ill patients admitted to Intensive Care Units and is associated with increased mortality, having a major impact on public health. Clinical complications are minimized with dialysis interventions, which expose patients to significant volumes of treated water during in-bed renal therapy. Microbiological analyzes and determination of bacterial endotoxins were performed on treated water samples and dialysate solutions in two public hospitals in São Paulo city, using analytical methodologies recommended in official compendia. The evaluation showed that the percentage of satisfactory results for treated water ranged from 35.2% to 100% in Hospital Unit I and from 40% to 100% in Hospital Unit II between 2010 and 2022. For dialysate solutions in Hospital Unit I, the percentage of satisfactory results was 100% during the same period. The effectiveness of actions implemented by the technical hospital teams, in adapting water for dialysis therapy, points to the importance of encouraging other hospital institutions to standardize and implement a program of continuous improvement for their water treatment systems used in dialysis procedures. This will help to prevent additional risks to patients exposed to renal therapy. (AU)

Panorama da qualidade biológica da água destinada ao tratamento dialítico em pacientes sob cuidados críticos em Unidades de Terapia Intensiva / Overview of the biological quality of water intended for dialysis treatment in patients under critical care in Intensive Care Units

A incidência da lesão renal aguda caracteriza-se como evento frequente em pacientes críticos internados em Unidades de Terapia Intensiva e está associada ao aumento de mortalidade, causando grande impacto à Saúde Pública. As intercorrências clínicas são minimizadas com intervenções dialíticas, acarretando a exposição do paciente a volumes expressivos de água tratada durante a terapia renal em leito. As análises microbiológicas e de determinação de endotoxinas bacterianas em amostras de água tratada e em soluções de dialisato foram executadas em dois hospitais públicos do município de São Paulo, seguindo metodologias analíticas preconizadas em compêndios oficiais. A avaliação demonstrou que a porcentagem de resultados satisfatórios no período de 2010 a 2022 variou entre 35,2 a 100% e de 40 a 100% para as unidades hospitalares I e II para a água tratada, respectivamente; e, 100% para as soluções de dialisato para a unidade hospitalar I. A eficácia de ações delineadas pelas equipes técnicas das unidades hospitalares, na adequação da água destinada à terapia dialítica, aponta para a importância em estimular outras instituições hospitalares na padronização e implantação de melhoria contínua de seus sistemas de tratamento de água para uso em procedimento dialítico, prevenindo riscos adicionais aos pacientes expostos à terapia renal.

The incidence of acute kidney is high among critically ill patients admitted to Intensive Care Units and is associated with increased mortality, having a major impact on public health. Clinical complications are minimized with dialysis interventions, which expose patients to significant volumes of treated water during in-bed renal therapy. Microbiological analyzes and determination of bacterial endotoxins were performed on treated water samples and dialysate solutions in two public hospitals in São Paulo city, using analytical methodologies recommended in official compendia. The evaluation showed that the percentage of satisfactory results for treated water ranged from 35.2% to 100% in Hospital Unit I and from 40% to 100% in Hospital Unit II between 2010 and 2022. For dialysate solutions in Hospital Unit I, the percentage of satisfactory results was 100% during the same period. The effectiveness of actions implemented by the technical hospital teams, in adapting water for dialysis therapy, points to the importance of encouraging other hospital institutions to standardize and implement a program of continuous improvement for their water treatment systems used in dialysis procedures. This will help to prevent additional risks to patients exposed to renal therapy.

Detection of Cutibacterium acnes in Tissue Samples from Clean Primary Shoulder Surgeries - Part II / Detecção de Cutibacterium acnes em amostras de tecidos de cirurgias limpas primárias do ombro - Parte II

Abstract Objective Research and identification of Cutibacterium acnes (C. acnes) and other microorganisms in deeptissue samples collected in clean shoulder surgeries of patients who did not undergo any previous invasive joint procedure and who had no clinical history of infection. Methods We analyzed the results of cultures of intraoperative deep tissue samples from 84 patients submitted to primary clean shoulder surgery. Tubes containing culture medium were used for storage and transport of anaerobic agents, prolonged incubation time, and mass spectrometer for diagnosis of bacterial agents. Results Bacteria growth was evidenced in 34 patients (40.4%) of the 84 included in the study. Of these, 23 had growth of C. acnes in at least one sample of deep tissue collected, corresponding to 27.3% of the total patients. The second most common agent was Staphylococcus epidermidis, present in 7.2% of the total individuals included. We showed a higher relationship between sample positivity and males, a lower mean age, absence of diabetes mellitus, ASA I score, and antibiotic prophylaxis in anesthetic induction with cefuroxime. Conclusions A high percentage of isolates of different bacteria was found in shoulder tissue samples of patients undergoing clean and primary surgeries, who had no history of previous infection. Identification of C. acnes was high (27.6%), and Staphylococcus epidermidis was the second most frequent agent (7.2%).

Resumo Objetivo Pesquisa e identificação de Cutibacterium acnes (C. acnes) e de outros microrganismos em amostras de tecidos profundos coletados em cirurgias limpas de ombro em pacientes que não foram submetidos a nenhum procedimento invasivo articular prévio e que não possuíam antecedentes clínicos de infecção. Métodos Foram analisados os resultados das culturas de amostras de tecidos profundos intraoperatórias de 84 pacientes submetidos à cirurgia limpa primária do ombro. Foram utilizados tubos contendo meio de cultivo para armazenamento e transporte de agentes anaeróbicos, tempo prolongado de incubação e espectrômetro de massa para diagnósticos de agentes bacterianos. Resultados Foi evidenciado o crescimento de bactérias em 34 pacientes (40,4%) dos 84 incluídos no estudo. Desses, 23 apresentavam crescimento de C. acnes em pelo menos uma amostra de tecido profundo coletada, correspondendo a 27,3% do total de pacientes. O segundo agente mais encontrado foi o Staphylococcus epidermidis, presente em 7,2% do total de indivíduos incluídos. Evidenciamos maior relação da positividade de amostras com o gênero masculino, uma média de idade inferior, a ausência de diabetes mellitus, o escore ASA I e a profilaxia antibiótica na indução anestésica com cefuroxima. Conclusões Verificou-se um elevado percentual de isolados de diferentes bactérias em amostras de tecidos de ombros de pacientes submetidos a cirurgias limpas e primárias e sem histórico de infecção anterior. A identificação de C. acnes foi elevada (27,6%) e o Staphylococcus epidermidis foi o segundo agente mais frequente (7,2%).

Diferencia en la expresión del ligando de receptor activador para el factor nuclear K B, en tejido tumoral frente a la infección por diferentes patógenos periodontales / Difference in receptor activator of nuclear factor K B expression in tumoral tissue by different periodontal pathogens

La enfermedad periodontal es una de las principales causas de pérdida dentaria. Clínicamente, esta patología, mediada por la desregulación del sistema inmune producto de una disbiosis ocurrida en el surco gingival, inicia con la inflamación de la encía y evoluciona con el daño irreversible de los tejidos que rodean el diente. El hueso alveolar es uno de los tejidos afectados esta patología, esto debido a la activación de osteoclastos por la sobreexpresión de la proteína RANKL en el huésped. El propósito de este trabajo es determinar el nivel de sobreexpresión de RANKL, en un modelo de células tumorales U2OS, frente a la infección con Porphyromonas gingivalis y Prevotella intermedia. Para identificar el nivel de RANKL, se definieron cuatro grupos: Un grupo control, no tratado; Grupo PG, tratado con P. gingivalis; Grupo PI, tratado con P. Intermedia; y un grupo PG+PI, tratado con ambas bacterias. El nivel relativo de la proteína RANKL fue determinado en el sobrenadante y en los extractos celulares de manera independiente, mediante la técnica Western blot. En sobrenadantes, el grupo PG mostró mayores niveles de RANKL comparados con PI (p < 0,05). En extractos celulares los niveles fueron mayores en el grupo PG+PI (p < 0,05). El grupo PI mostró los niveles más bajos de RANKL. La infección polimicrobiana resulta en una mayor expresión de RANKL en células tumorales U2OS, mientras que frente a la infección P. gingivalis, se observó mayor cantidad de RANKL soluble.

SUMMARY: Periodontal disease is one of the main causes of tooth loss. Clinically, this pathology, mediated by the deregulation of the immune system due to a dysbiosis occurred in the gingival sulcus, begins with the inflammation of the gum and evolves with the irreversible damage of the tissues that surround the tooth. Alveolar bone is one of the most affected tissues by this disease, due to the activation of osteoclasts by the upregulation of RANKL in the host. The aim of this study is to determine the increase of RANKL, in a U2OS tumor cells model, inoculated with Porphyromonas gingivalis and Prevotella intermedia. To identify the level of RANKL, four groups were defined: A control group, not treated; PG group, treated with P.gingivalis; PI group, treated with P. intermedia; and a PG+PI group, treated with both bacteria. The relative level of RANKL was determined in the supernatant and cell extracts independently, using the Western blot technique. In supernatants, the PG group showed higher RANKL levels compared to PI (p < 0.05). In cell extracts the levels were higher in the PG+PI group (p < 0.05.). The PI group showed the lowest levels of RANKL.Polymicrobial infection results in a greater expression of of soluble RANKL was observed.

Identification of antarctic soil bacteria exhibiting antiproliferative activity against a colon cancer cell line / Identificación de bacterias de suelo antártico que presentan actividad antiproliferativa sobre una línea celular de cáncer de colon

SUMMARY: Cancer is the second leading cause of death in the world and colorectal cancer is the only cancer that has shown a sustained increase in mortality in the last decade. In the search for new chemotherapeutic agents against cancer, extremophilic microorganisms have shown to be a potential source to obtain molecules of natural origin and with selective cytotoxic action towards cancer cells. In this work we analyzed the ability of a collection of Antarctic soil bacteria, isolated on Collins Glacier from the rhizosphere of Deschampsia antarctica Desv plant, to secrete molecules capable of inhibiting cell proliferation of a colorectal cancer tumor line. Our results demonstrated that culture supernatants from the Antarctic bacteria K2I17 and MI12 decreased the viability of LoVo cells, a colorectal adenocarcinoma cell line. Phenotypic and genotypic characterization of the Antarctic bacteria showed that they were taxonomically related and nucleotide identity analysis based on the 16S rRNA gene sequence identified the bacterium K2I17 as a species belonging to the genus Bacillus.

El cáncer es la segunda causa de muerte en el mundo y el cáncer colorrectal es el único que presenta un aumento sostenido de la mortalidad en la última década. En la búsqueda de nuevos agentes quimioterapeúticos contra el cáncer, se ha propuesto a los microorganismos extremófilos como una fuente potencial para obtener moléculas de origen natural y con acción citotóxica selectiva hacia las células cancerígenas. En este trabajo analizamos la capacidad de una colección de bacterias de suelo antártico, aisladas en el glaciar Collins desde rizosfera de la planta de Deschampsia antarctica Desv, de secretar moléculas capaces de inhibir la proliferación celular de una línea tumoral de cáncer colorrectal. Nuestros resultados demostraron que los sobrenadantes de cultivo de las bacterias antárticas K2I17 y MI12 disminuyeron la viabilidad de la línea celular de adenocarcinoma colorrectal LoVo, en un ensayo de reducción metabólica de MTT. La caracterización fenotípica y genotípica de las bacterias antárticas, demostró que estaban relacionadas taxonómicamente y el análisis de la identidad nucleotídica en base a la secuencia del gen ARNr 16S identificó a la bacteria K2I17 como una especie perteneciente al género Bacillus.

Empiema pleural por Parvimonas micra en un paciente inmunocompetente: reporte de un caso / Pleural empyema by Parvimonas micra in an immunocompetent patient: a case report

Se presenta el caso de un paciente joven inmunocompetente, con antecedente de tuberculosis pulmonar, que acude al hospital por un cuadro clínico subagudo de fiebre persistente, baja de peso, disnea y abolición del murmullo vesicular. La tomografía de tórax mostró un extenso empiema en hemitórax izquierdo. Se le toman muestras para detección de gérmenes comunes y se le colocan un tubo de drenaje torácico y se inicia antibioticoterapia. La prueba de MALDI-TOF MS identificó a Parvimonas micra, una bacteria anaerobia, comensal de la flora oral, asociado a periodontitis severa, escasamente reportado en empiema pleural, especialmente, en personas inmunocompetentes. En la evaluación odontológica se realizó el diagnóstico de gingivitis y pericoronaritis de la tercera molar. El paciente evolucionó favorablemente. Se sugiere que, en casos de empiemas pleurales subagudos o crónicos, se debe considerar, además de las micobacterias, como agente etiológico al Parvimonas micra, y optar por exámenes como MALDI-TOF MS o secuenciamiento del 16S rRNA, colocación de tubo de tórax, cobertura antibiótica empírica y evaluación odontológica.

We present the case of a young immunocompetent patient, with a history of pulmonary tuberculosis, who attended the hospital with a subacute clinical picture of persistent fever, weight loss, dyspnea and abolition of vesicular murmur. Chest CT scan showed an extensive empyema in the left hemithorax. Samples were taken for detection of common germs. Then, a chest drainage tube was placed and antibiotic therapy started. The MALDI-TOF MS test identified Parvimonas micra, an anaerobic bacterium, commensal to the oral flora, associated with severe periodontitis, but rarely reported in cases of pleural empyema, especially in immunocompetent patients. Gingivitis and pericoronaritis of the third molar were diagnosed during oral evaluation. The patient progressed favorably. Parvimonas micra should be considered as a possible etiological agent in cases of subacute or chronic pleural empyema, in addition to mycobacteria. Tests such as MALDI-TOF MS or 16S rRNA sequencing, chest tube placement, empirical antibiotic coverage and an adequate oral evaluation should be considered in these cases.

Atividade in vitro de extratos e frações de Copernicia prunifera (Arecaceae) contra bactérias de importância clínica em saúde pública / In vitro activity of extracts and fractions of Copernicia prunifera (Arecaceae) against bacteria of clinical importance in public health / Actividad in vitro de extractos y fracciones de Copernicia prunifera (Arecaceae) frente a bacterias de importancia clínica en salud pública

Introdução: O aumento contínuo da resistência bacteriana aos antibióticos convencionais é um problema de importância global. Encontrar produtos como alternativas terapêuticas naturais é essencial. As plantas medicinais possuem uma composição química muito rica, que podem ser estruturalmente otimizadas e processadas em novos antimicrobianos. Objetivo: Avaliar o potencial antibacteriano frente a microrganismos humanos potencialmente patogênicos do extrato etanólico e frações de Copernicia prunifera. Metodologia: A triagem fitoquímica de plantas foi realizada usando métodos de precipitação e coloração e a atividade antibacteriana utilizando o método de difusão em disco e microdiluição em caldo contra cepas padronizadas de Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa e Staphylococcus aureus. Resultados: A triagem fitoquímica revela a presença de taninos, flavonoides, esteroides, triterpernóides, saponinas e alcaloides. Os extratos etanólico e frações da casca do caule e folhas tiveram atividade inibitória contra S. aureus e K. pneumonie com zona de inibição que variou de 7,0±1,73 a 9,33±0,58 mm pelo método de difusão em disco. Pelo método de microdiluição em caldo os extratos foram satisfatórios somente contra K. pneumoniae (CIM = 125 a 1000 µg/mL) S. aureus, P. aeruginosa e E. coli se mostraram resistentes aos testes (CIM > 1000 µg/mL). Conclusão: Esses resultados fornecem uma base para futuras investigações em modelos in vivo, para que os compostos de C. prunifera possam ser aplicados no desenvolvimento de novos agentes antimicrobianos contra K. pneumoniae.

Introduction: The continuous increase in bacterial resistance to conventional antibiotics is a problem of global importance. Finding products as natural therapeutic alternatives is essential. Medicinal plants have a very rich chemical composition, which can be structurally optimized and processed into novel antimicrobials. Objective: To evaluate the antibacterial potential against potentially pathogenic human microorganisms of the ethanolic extract and fractions of Copernicia prunifera. Methodology: Phytochemical screening of plants was performed using precipitation and staining methods and antibacterial activity using the disk diffusion and broth microdilution method against standardized strains of Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus. Results: Phytochemical screening reveals the presence of tannins, flavonoids, steroids, triterpernoids, saponins and alkaloids. The ethanolic extracts and fractions of stem bark and leaves had inhibitory activity against S. aureus and K. pneumonie with zone of inhibition ranging from 7.0±1.73 to 9.33±0.58 mm by disc diffusion method. By broth microdilution method the extracts were satisfactory only against K. pneumoniae (MIC = 125 to 1000 µg/mL) S. aureus, P. aeruginosa and E. coli were resistant to the tests (MIC > 1000 µg/mL). Conclusion: These results provide a basis for further investigation in in vivo models, so that compounds from C. prunifera can be applied in the development of new antimicrobial agents against K. pneumoniae.

Introducción: El continuo aumento de la resistencia bacteriana a los antibióticos convencionales es un problema de importancia mundial. Es esencial encontrar productos como alternativas terapéuticas naturales. Las plantas medicinales tienen una composición química muy rica, que puede optimizarse estructuralmente y transformarse en nuevos antimicrobianos. Objetivo: Evaluar el potencial antibacteriano frente a microorganismos humanos potencialmente patógenos del extracto etanólico y fracciones de Copernicia prunifera. Metodología: Se realizó el cribado fitoquímico de las plantas mediante los métodos de precipitación y tinción y la actividad antibacteriana mediante el método de difusión en disco y microdilución en caldo frente a cepas estandarizadas de Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus. Resultados: El cribado fitoquímico revela la presencia de taninos, flavonoides, esteroides, triterpernoides, saponinas y alcaloides. Los extractos etanólicos y las fracciones de la corteza del tallo y las hojas presentaron actividad inhibitoria contra S. aureus y K. pneumonie con una zona de inhibición que osciló entre 7,0±1,73 y 9,33±0,58 mm por el método de difusión en disco. Por el método de microdilución en caldo, los extractos sólo fueron satisfactorios frente a K. pneumoniae (CMI = 125 a 1000 µg/mL). S. aureus, P. aeruginosa y E. coli fueron resistentes a las pruebas (CMI > 1000 µg/mL). Conclusiones: Estos resultados proporcionan una base para futuras investigaciones en modelos in vivo, de modo que los compuestos de C. prunifera puedan aplicarse en el desarrollo de nuevos agentes antimicrobianos contra K. pneumoniae.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

Abstract The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Resumo Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Antibacterial and bacteriostatic potential of coelomic fluid and body paste of Pheretima posthuma (Vaillant, 1868) (Clitellata, Megascolecidae) against ampicillin resistant clinical bacterial isolates / Potencial antibacteriano e bacteriostático do fluido celômico e pasta corporal de Pheretima posthuma (Vaillant, 1868) (Clitellata, Megascolecidae) contra isolados bacterianos clínicos resistentes à ampicilina

Abstract Pheretima posthuma (Vaillant, 1868), a native earthworm of Pakistan and Southeast Asia, has wide utilization in vermicomposting and bioremediation process. In this study, P. posthuma coelomic fluid (PCF) and body paste (PBP) was evaluated as antibacterial agent against ampicillin (AMP) resistant five Gram positive and four Gram negative clinical isolates. The antibacterial effect of different doses (i.e. 25-100 µg/ml) of PCF and PBP along with AMP and azithromycin (AZM) (negative and positive controls, respectively) were observed through disc diffusion and micro-dilution methods. All nine clinical isolates were noticed as AMP resistant and AZM sensitive. Antibacterial effects of PCF and PBP were dose dependent and zone of inhibitions (ZI) against all clinical isolates were between 23.4 ± 0.92 to 0 ± 00 mm. The sensitivity profile of PCF and PBP against clinical isolates was noticed as 44.44 and 55.56%, respectively. Both PCF and PBP showed bacteriostatic (BTS) action against S. aureus, S. pyogenes, K. pneumonia, N. gonorrhoeae. Moreover, the cumulative BTS potential of PCF and PBP against all isolates was 66.67 and 55.56%, respectively. The MICs of PCF and PBP were ranged from 50-200 µg/ml against selected isolates. The bacterial growth curves indicated that PCF and PBP inhibited the growth of all isolates at their specific MIC concentrations. However, PBP has better antibacterial potential compared to PCF against selected isolates. Therefore, it is concluded that both PCF and PBP of P. posthuma possess antibacterial and BTS potential against ampicillin resistant clinical isolates. This organism might be considered as a second choice of antibacterial agents and can further be utilized in pharmaceutical industries for novel drug manufacturing by prospecting bioactive potential agents.

Resumo Pheretima posthuma (Vaillant, 1868), uma minhoca nativa do Paquistão e sudeste da Ásia, tem ampla utilização em processos de vermicompostagem e biorremediação. Neste estudo, o fluido celômico de P. posthuma (PCF) e a pasta corporal (PBP) foram avaliados como agente antibacteriano contra cinco isolados clínicos Gram-positivos e quatro Gram-negativos resistentes à ampicilina (AMP). O efeito antibacteriano de diferentes doses (ou seja, 25-100 µg / ml) de PCF e PBP juntamente com AMP e azitromicina (AZM) (controles negativo e positivo, respectivamente) foi observado por meio de métodos de difusão em disco e microdiluição. Todos os nove isolados clínicos foram notados como resistentes a AMP e sensíveis a AZM. Os efeitos antibacterianos de PCF e PBP foram dependentes da dose e a zona de inibição (ZI) contra todos os isolados clínicos foi entre 23,4 ± 0,92 a 0 ± 00 mm. O perfil de sensibilidade do PCF e PBP contra isolados clínicos foi observado como 44,44% e 55,56%, respectivamente. Tanto o PCF quanto o PBP mostraram ação bacteriostática (BTS) contra S. aureus, S. pyogenes, K. pneumonia, N. gonorrhoeae. Além disso, o potencial BTS cumulativo de PCF e PBP contra todos os isolados foi de 66,67% e 55,56%, respectivamente. Os MICs de PCF e PBP variaram de 50-200 µg / ml contra isolados selecionados. As curvas de crescimento bacteriano indicaram que o PCF e o PBP inibiram o crescimento de todos os isolados em suas concentrações específicas de MIC. No entanto, PBP tem melhor potencial antibacteriano em comparação com PCF contra isolados selecionados. Portanto, conclui-se que tanto o PCF quanto o PBP de P. posthuma possuem potencial antibacteriano e BTS contra isolados clínicos resistentes à ampicilina. Esse organismo pode ser considerado como uma segunda escolha de agentes antibacterianos e pode ainda ser utilizado nas indústrias farmacêuticas para a fabricação de novos medicamentos por meio da prospecção de agentes com potencial bioativo.

Infecciones oculares: un estudio de caracterización y perfil de resistencia antibiótica / Ocular infections: characterization and antibiotic resistance profile

Introducción: Las infecciones oculares son patologías frecuentes asociadas a secuelas graves como la ceguera y se convierten en un potencial problema en salud pública. Su perfil epidemiológico, en cuanto a su etiología, es conocido a nivel mundial, pero los perfiles locales son desconocidos, limitando los esfuerzos terapéuticos dirigidos para compartir dicho problema. Objetivo: Caracterizar los principales gérmenes encontrados en los cultivos tomados de la córnea y la secreción conjuntival de pacientes de un centro de referencia oftalmológica de Medellín. Método: Estudio descriptivo, observacional y retrospectivo a partir de los resultados de cultivos, realizando un análisis en función de variables categóricas emitiendo porcentajes y frecuencias. Resultados: Se obtuvieron 176 cultivos en total: el 61.4% fue de córnea y el 34.1% de conjuntiva; los gérmenes más frecuentemente aislados fueron Pseudomonas en un 25%, Staphylococcus aureus con un 20% y Fusarium con un 15%. Conclusión: Los gérmenes más frecuentes que encontramos en este estudio coinciden con los que habitualmente se reportan en la literatura

Background: Eye infections are frequent pathologies associated with serious sequelae such as blindness and they become a potential public health problem. Its epidemiological profile, in terms of its etiology, is known worldwide, but the local profiles are unknown, limiting targeted therapeutic efforts to share this problem. Objective: To characterize the main germs found in cultures taken from the cornea and conjunctival secretion of patients at an ophthalmological reference center in Medellín. Method: Descriptive, observational, and retrospective study based on the results of cultures, carrying out an analysis based on categorical variables, issuing percentages and frequencies. Results: A total of 176 cultures were obtained: 61.4% were from the cornea and 34.1% from the conjunctiva; the most frequently isolated germs were Pseudomonas in 25%, Staphylococcus aureus with 20% and Fusarium with 15%. Conclusion: The most frequent germs that we found in this study coincide with those that are usually reported in the literature

El papel del laboratorio de microbiología en la práctica clínica / The role of the microbiology laboratory in clinical practice

Los seres humanos albergamos en el cuerpo a cientos de miles de microbios (bacterias, virus, hongos, archaea). Con la mayoría convivimos armónicamente, y obtenemos beneficios mutuos. Ellos participan activamente en nuestros procesos metabólicos e inmunológicos, y nosotros les damos vivienda y nutrientes [1]. Si el equilibrio se altera, como ocurre cuando el sistema inmune se suprime, algunos de estos microorganismos aprovechan la oportunidad y desencadenan infección [2], siendo este el origen de la mayoría de las infecciones, pero no el único, pues los ambientes externos al cuerpo humano también están poblados de microbios, y si bien pocos se consideran patógenos, al entrar en contacto con ellos adquirimos infecciones que llamamos exógenas. De acuerdo con la Organización Mundial de la Salud (OMS), las enfermedades transmisibles están entre las 10 principales causas de muerte en el mundo, y excluyendo la infección por SARS-CoV-2 (COVID-19) en 2021, las infecciones respiratorias agudas fueron la cuarta causa más frecuente de defunción a nivel mundial [3]. El laboratorio de microbiología clínica tiene un papel crucial en el proceso diagnóstico, terapéutico y preventivo de las enfermedades infecciosas causadas por bacterias, hongos, virus y parásitos, pues determinar el agente causal de manera eficaz permite tomar acciones oportunas para definir el manejo individual de las personas infectadas y cortar la cadena de transmisión cuando se requiera [2]